日本医学留学机构包括但不限于以下几所：
东京大学医学部
日本顶尖医学院校之一，历史悠久，教学质量卓越。
拥有多个研究科和附属医院，以及与世界级研究机构合作。
京都大学医学部
与东京大学齐名的日本顶尖医学院校，享有高声誉。
强大的师资力量和先进的教学设施，培养了多位诺贝尔奖得主。
大阪大学医学部
拥有丰富的医学传统，提供广泛的医学专业选择和实践机会。
医学研究科在某些方面甚至超过了东京医科齿科大学。
庆应义塾大学医学部
私立大学中的佼佼者，医学部教育水平高，但学费相对较高。
东京医科齿科大学
拥有医学部和齿学部，是日本著名的综合性国立大学。
在医学领域的研究实力雄厚，齿学部享有全球高声誉。
其他推荐院校
东北大学、名古屋大学、九州大学、三重大学、新潟大学、金泽大学、东海大学、顺天堂大学等，在医学领域表现不俗。
选择留学机构时，建议考虑机构的教学质量、师资力量、研究设施、毕业生就业情况等因素。同时，也可以参考留学机构的排名和口碑，以及个人的学术和职业目标。