初中保留学籍通常有以下几种情况：
因病休学：
学生因病或其他特殊原因连续三个月无法到校学习，可持医院证明向学校申请休学。
特殊原因：
如有其他特殊原因需要保留学籍，如应征入伍等，学生可向教务处提交相关审批表和证明。
违反校规：
学生如有违反学校规定的不良行为，如打架斗殴等，学校可决定让其回家反省或转学到其他学校。
借读：
学生若要挂学籍去其他学校借读，必须先向原学校提交保留学籍申请，并经过学校领导和教育部门批准后，方可联系其他学校借读。
自行学习：
部分学生可能选择在家自学并通过考试，但这种情况需要得到班主任的同意。
无学籍学生：
对于没有建立外地学籍的学生，需要向暂住地教育行政部门申请学籍，并在户籍所在地备案。
办理保留学籍的具体流程可能因地区和学校而异，建议直接咨询当地教育部门或就读学校获取详细信息。需要注意的是，以上信息基于过往的规定，具体操作应以最新的政策和学校规定为准。