在日本留学租房时，房租的付款方式如下：
预付房租
房租通常需要按月支付，并且通常在月底前预付下个月的房租。付款方式一般通过银行转账进行。
押金
押金数额通常相当于1-1.5个月的房租。在合同到期时，如果房屋无损，押金将如数退还给房客。
礼金
礼金是一种感谢费，通常为1-2个月的房租。不过，现在越来越多的房子已经不再收取礼金。
公共费（共益费）
公共费包括楼梯、通道、公用厕所等公用部分的电费、水费、清扫费和管理费等。这部分费用一般由所有房客共同承担。
维修费（管理费）
维修费是用于大楼所有房客的每月维护费用，数额较小。
火灾保险费
火灾保险费是用于购买火灾保险的费用，一般每年约为2万日元左右。
钥匙更换费
钥匙更换费大约在16000-20000日元之间。
其他费用
其他费用包括清洁费、违约金等。清洁费在退房时需要支付，大约为10000-20000日元。违约金在签订合同时约定，提前搬走或提前终止合同需要支付1个月租金的罚金。
建议
提前规划：在签订租赁合同前，务必仔细阅读合同条款，了解所有费用和付款方式，确保自己能够按时支付各项费用。
选择中介：如果对租房流程不熟悉，建议选择专业的租房中介机构，他们可以提供专业的咨询和帮助，避免因不了解当地规定而产生不必要的麻烦。
记录证据：在搬入和搬出时，务必记录房屋的现状，以便日后维护自己的权益。