申请日本高校留学生奖学金的过程如下：
了解奖学金类型
日本留学奖学金主要有三种类型：文部科学省负责的“留学生奖学金”、日本国际教育支援协会（JASSO）奖学金和日本大学自设奖学金。
准备申请材料
申请材料通常包括申请表、最终学历证明、学业成绩证明、语言能力证明、研究计划书、推荐信等。
联系导师
通过邮件第一次和目标导师联系，自荐信内容应包括自我介绍、研究兴趣、研究成果、意向表达等，并询问教授是否接受留学生。
收集和整理资料
上网搜索各大学的官方网站，找到相关实验室页面，查看实验室的研究方向、条件、教授水平和知名度等，并收集教授的email地址。
筛选实验室和教授
留下10-15个左右的实验室，并向这些实验室的教授发送留学申请的自荐信。
保持主动联系
主动与学校保持联系，主动和学部长联系，展示自己在学术上的能力。
注意推荐人的研究业绩
推荐人的研究业绩和学术地位很重要，而非官衔或职位。
注意申请时间
不同类型的奖学金申请时间不同，例如JASSO奖学金的申请时间一般在每年5月份开始，文部科学省留学生奖学金的申请时间为每年6月份，提前关注奖学金申请时间。
面试环节
面试环节是申请奖学金过程中的重要一环，需要充分准备。
申请政府奖学金
可以通过日本的驻外使（领）馆或通过日本的大学申请日本政府（文部科学省）奖学金。
申请地方自治体奖学金
地方政府及国际交流团体为居住在当地或在当地大学学习的留学生设立的奖学金，留学生可以自由申请。
申请民间团体奖学金
民间企业或民间奖学团体提供的奖学金，申请条件多样，金额在5万 - 15万日元左右。
申请学校奖学金
学校设置的奖学金，如入学奖学金、学业优秀奖学金等，申请时间一般为每学期开学后的一段时间或学年末。
建议提前准备，充分了解各种奖学金的申请条件和流程，以提高申请成功率。