在众多留学机构中，以下几家在申请日本留学方面备受推崇：
芥末留学：
成立于大连，拥有自己的网站芥末网和专业的留学顾问团队。其最大优势是零中介费，并在申请日本留学方面非常有经验。
蔚蓝留学：
成立于1996年，总部在山东，是国家批准的留学中介公司。该机构主要业务以日韩为主，特色是零中介费申请。
新通留学：
成立于1996年，已成长为中国领先的国际化教育集团，涵盖游学、语培、国际课程、留学规划等领域。在日本留学业务上，其在南方留学市场很有影响力。
启德留学：
是中国较早聚焦于国际教育一站式服务的企业，在35个城市设立了58家分支机构。虽然主要业务不是日本留学，但从其学生分布来看，申请日本留学是比较有优势的。
前程日本：
是目前中国最有影响力的日本读研申请高端专业品牌，专注于日本读研领域，提供申请全流程操控服务，与日本留学中介行业采用申请环节外包的模式有着迥异的不同，申请全流程可控也保证了学生的申请高成功率和稳定性。
达人日本：
2001年诞生于日本东京，是最早进行日本国公立大学研究生申请的机构，中国唯一一家源自于日本的留日品牌。其服务涵盖出国手续、接机住宿、手机代办、网络代办、工作介绍、社会活动、进学支援、毕业就职等，并为家长提供周到的后续服务。
樱花国际日本留学：
国内领先的国际教育机构，拥有丰富的国际教育资源，特别在申请日本留学方面具有明显优势。其顾问老师从业服务态度专业而且随和，提供一站式服务。
这些机构各有特色，建议您根据自己的需求和实际情况，选择最适合自己的留学机构。