办理学校保留学籍的流程通常包括以下几个步骤：
提交申请和相关材料
学生需要填写《学生保留学籍申请表》。
准备入伍通知书复印件和学费发票原件等相关材料。
缴费核查
将材料提交给所在二级学院的教学秘书。
教学秘书核查学生缴费情况，未交清费用的学生必须结清费用。
审批流程
二级学院审批同意后，教学秘书将材料交教务处。
教务处审批后将结果通知二级学院，由二级学院通知学生。
办理退费 （如适用）：
涉及退费的，由教学秘书办理退费手续。
注意事项
办理流程以教务处最新通知为准。
特殊情况（如身体原因、家庭事务等）需要提供相应证明材料。
法律依据：《高中学籍管理规定》第十六条。
请根据你所在学校的具体规定和流程进行操作，如果有疑问，可以咨询学校教务处或法律顾问。