留学生在日本需要准备以下证件：
护照：
这是国际旅行的身份证，也是在国外的重要身份证明。请确保护照在出发前至少还有6个月的有效期。
签证：
根据留学计划，可能需要申请学生签证（留学签证）。请按照日本大使馆或领事馆的要求准备相关材料，并及时申请。
在留资格认定书（COE）：
这是申请签证时必须提交的文件，由日本法务省发放，证明已获得在日本留学的资格。在获得学校录取后，按照学校指导准备相关材料申请COE。
在留卡：
入境日本后，如果居留期限超过3个月，需要在机场或当地入国管理局办理在留卡。这是日本的身份证明，需要随时携带。
资格外活动许可：
如果计划在日本打工，需要在抵达日本机场时申请资格外活动许可。提前了解申请流程，并准备好相关材料。
再入国许可：
中长期居留的外国人离境超一年需申请再入国许可，否则将失去居留资格。短期离境（一年内）可使用“视同再入国许可”。
国民健康保险证：
居住3个月以上的外国人必须加入国民健康保险，持有该保险证的留学生在就医时只需支付30%的医疗费用，其余70%由政府承担。此外，国民健康保险证也可用于身份确认。
其他补充材料：
根据具体学校和签证类型的不同，可能还需要提供其他补充材料，如学校申请表格、身份证复印件、户口本复印件、最高学历毕业证书或在读证明、成绩单、日语学习证明、经费担保人的相关证明、亲属关系公证等。
建议提前准备好所有必要的证件和材料，以确保顺利入境并在日本开始留学生活。