在选择拱墅区留学日本的机构时，可以考虑以下几个因素：
机构的资质和信誉：
选择有正规资质和良好信誉的机构，以确保留学申请和签证申请的顺利进行。
机构的专业程度：
选择专业的留学机构，提供专业的留学咨询、申请和签证服务。
机构的服务质量：
选择服务质量好的机构，提供周到、贴心的服务。
机构的价格合理：
选择价格合理的机构，避免花费过多的留学费用。
机构的特色服务：
一些机构可能提供个性化的服务，如一对一咨询、定制化留学方案等。
根据以上因素，以下是几家在拱墅区提供日本留学服务的机构：
格致学苑：位于杭州市拱墅区嘉德广场1201室，提供日本留学升学辅导，拥有国内外一体化教学模式。
樱花国际：主打日本留学的中介机构，提供日语培训、办理留学签证等服务，注重听说能力的培养。
新通留学：成立于2006年，提供包括日本在内的多国留学服务，拥有丰富的资源和申请经验。
中青留学：提供自费出国留学中介服务，包括日本在内的多个国家留学业务。
学习谷：总部位于日本东京，提供从语言培训到学校申请的全方位服务，帮助学生定制个性化的留学方案。
建议在选择留学机构前，进行详细的调研和比较，考虑自己的具体需求，并咨询多家机构以获取更多信息。同时，也可以参考其他学生的评价和成功案例，以便做出更明智的选择。