办理日本留学签证的流程通常包括以下几个步骤：
准备护照
确保已有有效护照，并检查护照有效期截止日期。
申请在留资格认定证明书
向录取的日本大学招生办或学院的事务所寄出办理在留资格认定证明书所需的材料。
接收日本大学寄来的在留资格认定证明书。
准备签证材料
包括但不限于：签证申请表、护照、户口本复印件、居住证、在留资格认定证明书原件及复印件等。
递交签证申请
前往日本驻中国大使馆或总领事馆指定的代办机构办理签证。
缴纳签证费用，并等待电话调查。
领取签证
一周后凭收据领取留学签证。
额外材料（视情况而定）：
可能需要提供留学调查表、学费支付者的在职证明、毕业证明书或毕业证书复印件等。
在疫情等特殊时期，可能还需要提供身元保证书、誓约书等材料。
请注意，以上流程和所需材料可能会根据具体情况和使领馆的要求有所变化，建议提前咨询日本驻华大使馆或领事馆获取最新信息。