日本留学保证金的申请流程通常包括以下几个步骤：
准备资金
根据日本入国管理局的要求，准备相应的保证金金额，通常为20万人民币左右。
保证金需要以定期存款的形式存入银行，并确保在签证申请通过后的一段时间内保持冻结状态。
选择银行
尽量选择中国四大银行（如中国银行、工商银行、建设银行、农业银行）之一进行存款。
如果资金分散在多个银行，建议将资金归拢到一个银行再统一开具存款证明。
存款
将所需金额存入定期存单，存期通常为3个月至6个月，具体根据申请时间和入管局要求而定。
开具存款证明
向银行申请开具存款证明，该证明将显示存款金额、存期、货币种类等信息。
存款证明需要在材料提交入管局前夕开具，至少3个月以上，6个月则更为稳妥。
提交材料
在申请签证时，将存款证明作为重要的经济证明文件提交给签证官。
如果资金由他人提供，还需提供资金来源证明，如父母的收入证明、银行流水等。
注意事项
确保所有提交的材料信息一致，包括姓名、出生日期、护照号码等。
存款证明到期后，个人存款会自动解除止付，除非有特别要求提前解除。
请根据最新的政策和要求准备相应的材料，并咨询具体银行或日本入国管理局获取最准确的信息。