高中保留学籍自学可能面临一些挑战和限制，以下是主要原因：
缺乏系统复习：
在家中自学可能缺乏学校系统性的复习计划和方法，这可能会影响学习效果。
校园氛围：
学校环境通常有助于学生集中注意力，在家中自学可能会受到各种干扰，降低学习效率。
教师指导：
经验丰富的老师可以提供个性化的指导和帮助，在家自学可能无法获得同等质量的教育资源。
学籍保留条件：
虽然理论上可以保留学籍，但学校可能不会轻易同意，因为这不符合常规的教育流程。
高考报名：
保留学籍的学生在一定条件下可以参加高考，但需要与学校沟通并遵守相关规定。
休学条件：
如果学生因身体原因需要休学，必须提供县级以上二级医院的正式证明，并符合休学条件。
综上所述，虽然保留学籍在家自学是可行的，但实际操作中可能会遇到种种困难，而且效果不一定理想。是否选择在家自学，学生和家长需要综合考虑各方面因素后做出决定