日本留学签证被拒签可能由多种原因造成，以下是一些常见的原因：
经费支付问题
未能提供足够的资金证明，如银行存款证明，以证明有足够的经济能力支付在日本的学习和生活费用。
提供的资金证明与申请人的经济状况不符，如父母的年收入证明与实际收入存在明显差异。
材料问题
提交的申请材料不完整或存在虚假信息，如毕业证书、成绩单等。
材料中的信息不匹配或不具有合理性，如学习履历和就学理由不一致。
语言能力不足
无法提供足够的日语能力证明，如日语学时证明或日语能力水平考试证书。
在留经历和不良记录
申请人有被遣返或强制驱逐的记录，或有未申报过去的入国经历。
学习动机不明确
申请人未能合理解释自己的留学动机，或提供的动机与实际情况不符。
其他个人问题
申请人有犯罪历史，或在过去有吸食麻醉剂、大麻等不良记录。
如果您的日本留学签证申请被拒绝，建议您仔细阅读拒签理由书，并根据具体原因进行针对性的准备和改善。如果需要进一步的帮助，可以咨询专业的留学顾问或律师。