赴日本留学办理护照的流程如下：
准备材料
填写完整并贴有本人近期正面免冠照片的"中国公民出国申请审批表"一式二份和2张照片（照片规格二寸）。
提交与出境事由相应的证明材料，如接受学校出具的入学通知书、经济保证证明等。
交验申请人居民身份证或户口簿，并提交其复印件。
未满十六周岁的公民，应当由其监护人陪同，并提交其监护人出具的同意出境的意见、监护人的居民身份证或者户口簿、护照及复印件。
提交申请
向本人户口所在地市、县公安局出入境管理部门提出申请，回答有关询问并履行上述手续。
照片要求
照片需要在公安机关出入境管理机构现场拍摄，不能用自带的照片。
费用
具体申请费用需要咨询当地的公安机关出入境管理机构，一般不会太贵。
护照有效期
现在的护照一般有效期限是十年。
其他注意事项
旅游护照和留学护照都属于普通护照，申请下来基本一样，不同之处就在于填写申请表中的出国目的。
在居民身份证领取、换领、补领期间，可以提交临时居民身份证和户口簿及复印件。
建议提前准备好所有材料，并咨询当地公安机关出入境管理机构以获取详细的申请信息和费用情况。