对于在日本留学的学生犯罪的情况，根据中国《刑法》第七条和第十条的规定，可以总结如下：
属人管辖原则
如果行为在日本，且日本已经立案侦查，则按照日本法律办理。
如果之后回到中国，根据属人管辖原则，适用中国《刑法》。
刑事责任追究
根据《刑法》第七条，中国人在国外犯罪，如果按照中国《刑法》规定应负刑事责任，即使经过外国审判，仍然可以依照中国《刑法》追究。
但是，如果所犯罪行的最高刑为三年以下有期徒刑，可以不予追究。
如果在日本已经受到刑事处罚，根据《刑法》第十条，可以免除或者减轻处罚。
例外情况
对于中国国家的公务员和军人，在中华人民共和国领域外犯罪，同样适用中国《刑法》。
需要注意的是，这些规定可能会随着法律的修订和变更而有所调整。因此，具体情况还需结合最新的法律信息进行判断。