保留学籍的流程根据不同类型的学生（在校生、高校新生）和不同的情况（应征入伍、休学等）有所不同。以下是详细的流程：
在校生学籍保留流程
收到《入伍通知书》
在校生收到《入伍通知书》后，需要开始办理保留学籍的手续。
携带必要材料
携带《保留入学资格申请表》和《入伍通知书》到学校相关部门办理。
学校审核与备案
学校收到申请材料后，会依法依规审核录取资格，办理保留入学资格手续，并在学生个人信息中标注“参军入伍”。学校会出具《保留入学资格通知书》，并将相关信息备案。
高校新生入学资格保留流程
填写申请表
高校新生需持高校录取通知书、身份证（户口簿）、高中毕业证书及一寸照片2张，到入伍地县（市、区）人民政府征兵办公室领取并填写《应征入伍普通高等学校录取新生保留入学资格申请表》一式两份。
征兵办盖章确认
征兵办公室汇总本辖区所有入伍高校新生的申请表并加盖公章确认，然后将申请表连同《入伍通知书》复印件寄送至相关高校招生部门。
学校确认并保留学籍
高校收到申请材料后，会在学生个人信息中标注“参军入伍”，并在申请表上加盖公章，出具《保留入学资格通知书》。一份申请表由学校留存备案，一份交征兵办备案，通知书交入伍高校新生或委托人保管。
退役复学
退役后，学生需要向学校提交相关证明材料，学校会依法依规审核并办理复学手续。
休学并保留学籍流程
提交申请及相关证明
学生本人提交保留学籍或保留入学资格申请书，并提供申请原因的相关证明、家长身份证复印件（需家长签字或传真件）。
办理成绩认定与报批
学生到系教务办公室办理成绩认定手续并领取成绩单（新生无需办理此程序），然后携带相关报批材料到教务处学籍管理科办理报批程序。
离校手续
学生办理完成《离校程序单》后，将其交回教务处学籍管理科，由学籍管理科审查资料并办理相关异动处理。
系统异动与资料归档
教务处学籍管理科在审查完所有资料后，会在青果系统和学信网上做相关异动处理，并打印保留学籍证明，发放《离校程序单》。
注意事项
不同学校对保留学籍的规定可能存在差异，学生需要先仔细阅读学校的相关规定，了解自己是否符合条件，需要准备哪些材料，办理流程是怎样的等等。
在办理保留学籍的过程中，学生可能需要缴纳一定的费用，具体的费用标准需要根据学校的规定而定。
有些学生在办理保留学籍时可能会遇到一些特殊情况，例如因病请假、缺考等，针对这些情况，学生需要提供相应的医疗证明或者原因说明材料，以便学校能够做出合理的处理。
以上流程仅供参考，具体操作还需根据所在学校的具体规定进行。