如果你在日本留学期间丢失了签证，可以按照以下步骤补办：
通知相关机构
通知日本移民局你的护照及签证丢失情况。
同时通知你的学校，请求延期开学日期。
报案及取得证明
向当地丢失区域派出所报案，并索取报案证明。
登报声明
在当地市级以上出入境管理处指定的报纸上刊登丢失声明。
补办护照
携带你的身份证及户口本，到当地出入境管理处办理补办护照手续。
办理手续的规定周期通常为3个月。
补办签证
取得新护照后，与日本的使馆或领事馆取得联系。
递交报案证明和报纸登报丢失声明的复印件，办理签证补发手续。
请注意，如果你是在国外丢失护照，需要根据具体情况与领事馆或中国使领馆联系，可能需要提供身份证明和签证复印件，并可能需要支付一定的费用。