申请日本留学担保人的流程如下：
准备存款
将所需担保金（通常为20万元人民币）存入申请人的经费支付人名下，存期为半年。不建议存入银行卡或存折，而应存为定期存单。
获取存款证明
向银行申请存款证明，可以选择截止日期为申请在留资格的那一天。存款证明需要包括存单原件和存单的彩色复印件。务必保留好所有相关银行单据，以备后续解释资金来源之用。
冻结担保金
担保金在开具存款证明后需要冻结，冻结期一般为3至6个月，直至日本入国管理局审核通过申请人的在留资格申请。
提交材料
将存款证明和存单原件提交给日本入国管理局。同时，需要提交个人身份证件原件、代办人身份证件（如委托他人代办）、填写完整的《存款证明委托书》以及支付给银行的手续费。
注意资金解释
如果存款在多个银行，建议将资金归拢到一个银行再统一开具存款证明，以便更好地解释资金来源。
关系说明
申请人与经费支付人之间应具有一定的血缘关系，如父母、兄弟姐妹等。日本入国管理局通常要求担保人与被担保人之间存在法律可以认定的家庭关系。
其他证明文件
如果担保人是日本公民或在日居住者，需要提供合法的日本居留资格证明，如工作签证、留学签证等，并附上邀请信和探亲人在日本的住宿证明等。
通过以上步骤，您可以完成日本留学担保人的申请。请确保所有文件的真实性和完整性，以避免因资料问题导致签证拒签。