日本留学护照的作用主要体现在以下几个方面：
出入境必备文件：
护照是出入国境的必要证件，持有护照才能合法地进行国际旅行。
免签待遇：
日本护照在全球范围内享有较高的免签待遇，根据Henley&Partners的2024年最新版全球护照实力排名，日本护照免签194个国家和地区，位于世界护照第一梯队，持有日本护照几乎可以免签环游世界。
身份证明：
在日本，外国人登录手续完成后会发给外国人登录证明书（外国人登录证），该证在日常生活中作为护照的替代，用于证明个人身份，外出时必须随身携带，并在遇到警察等政府行政官员检查时出示。
享受教育福利：
拥有日本护照的学生可能有机会享受更多的学校资源和国际学校的入学资格，因为一些国际学校要求第三国护照作为入学标准。
便于国际旅行：
护照作为国际旅行的重要证件，持有日本护照可以更方便地进行国际旅行和出差。
综上所述，日本留学护照不仅是出入国境的必备文件，还可以享受免签待遇，作为身份证明，并有助于学生在教育和国际旅行方面获得更多便利。建议留学生在留学前确保护照的有效性和完整性，并了解相关使用规定。