南京和杭州对于留学补贴的金额和条件有所不同。以下是具体的比较：
杭州
萧山区：
博士学位：8万元生活补贴。
硕士学位：6万元生活补贴。
本科学位：4万元生活补贴。
余杭区：
毕业5年内可申请生活补贴3万元。
钱塘新区：
无福利，仅提供给世界前200高校的海归生活补贴。
南京
本科：每人每月补贴600元，累计不超过36个月。
硕士：每人每月补贴800元，累计不超过36个月。
博士：每人每月补贴2000元，累计不超过36个月。
租赁补贴：
本科：每月600元，可连续领取5年。
硕士：每月800元，可连续领取5年。
博士：每月2000元，可连续领取5年。
建议
杭州：如果计划在萧山区工作，博士学位可以获得8万元的生活补贴，硕士学位可获得6万元，本科学位可获得4万元。如果考虑在余杭区工作，毕业5年内可以申请3万元的生活补贴。
南京：对于本科、硕士和博士，分别可以获得每月600元、800元和2000元的补贴，累计不超过36个月。此外，还可以申请租赁补贴，具体金额和领取年限与学历相关。
根据以上信息，如果选择在南京工作，建议充分利用租赁补贴政策，因为本科、硕士和博士的补贴标准都相对较高，且可以连续领取5年。如果在杭州工作，建议优先考虑萧山区的生活补贴政策，尤其是对于博士学位人员。