日本留学需要整理的重要物品包括：
护照：
随身携带，注意保管，出入境时需要出示。
机票：
随身携带，纸质机票需妥善保管，现在电子机票也常见。
在留资格认定书：
与护照同等重要，在日本入境时要查验。
入学许可书：
最好与护照放在一起，出机场时要查验。
印章：
准备两个印章，一个姓氏章，一个全名章，用于办理各种手续。
照片：
准备彩色证件照若干张，用于办理手续。
现金：
至少带三个月的生活费，大约30万日元，以及适量零钱。
体检证明：
随身携带，入境时可能会检查。
毕业证书和成绩单：
最终学历的毕业证和大学期间成绩单。
学校联系方式：
写有学校地址、联系电话等信息的通讯录。
眼镜：
近视的同学可多带一副备用，日本配眼镜可能较贵。
文具：
可携带国内使用的文具。
小电器配件：
如耳机、U盘、电脑摄像头等。
其他：
根据个人需要携带适当的衣物鞋帽，以及可能需要的电子词典等。
请确保所有文件都是最新的，并且备份好重要文件的复印件。此外，了解并遵守日本的入境规定和海关要求也是必要的。