河海大学下设多个学院及专业，涵盖工、理、文、经、管、法、哲、史、医等多个学科门类。以下是河海大学的主要学院及其专业设置：
水文水资源学院
水文与水资源工程
自然地理与资源环境
水务工程
水利水电学院
水利水电工程
港口海岸与近海工程学院
港口航道与海岸工程
土木与交通学院
土木工程
交通工程
环境学院
环境工程
给排水科学与工程
环境科学
环境生态工程
能源与电气学院
电气工程及其自动化
自动化
能源与动力工程
新能源科学与工程
信息学部
计算机科学与技术
通信工程
电子信息工程
物联网工程
人工智能学院
力学与材料学院
工程力学
材料科学与工程
地球科学与工程学院
地理信息科学
地质工程
测绘工程
农业科学与工程学院
农业水利工程
设施农业科学与工程
机电工程学院
机械工程
金属材料工程
工业设计
能源与动力工程
数字媒体艺术
机器人工程
海洋学院
海洋科学
海洋技术
理学院
数学与应用数学
信息与计算科学
应用物理学
商学院
工程管理
信息管理与信息系统
财务管理
工商管理
市场营销
会计学
人力资源管理
电子商务
国际经济与贸易
经济学
公共管理学院
劳动与社会保障
广播电视学
播音与主持艺术
土地资源管理
社会学
法学院
法学
马克思主义学院
思想政治教育
外国语学院
英语
法语
体育系
河海里尔学院（中外合作办学机构）
大禹学院（拔尖人才培养学院）
远程与继续教育学院
国际教育学院
此外，河海大学在第四轮学科评估中，水利工程评为A+学科，土木工程、环境科学和工程评为A学科，马克思主义理论、管理科学与工程和工商管理评为B+学科，社会学、力学、计算机科学与技术、农业工程和软件工程评为B学科，电气工程、信息与通信工程、测绘科学与技术、地质资源与地质工程、公共管理评为B-学科。
建议：学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，结合各个学院的专业优势和学科评估结果，做出更为明智的选择。