日本留学中介的收入主要来源于中介服务费，其费用标准如下：
中介服务费：
通常在1万元人民币左右。这一费用涵盖了咨询、申请材料准备、学校推荐等服务。
境外服务费：
一般约为3万元人民币，涵盖了签证申请、入学手续办理、住宿安排等一系列服务。
其他费用：
可能还包括语言培训、考试费用等，具体视个人情况而定。
综合来看，通过留学中介办理日本留学的整体费用大约在4万元人民币左右。不同中介之间的收费可能会有一些差异，例如某些中介可能会收取稍高的中介费，而有些则可能将部分费用作为佣金免费提供给学生。
因此，选择留学中介时，建议学生和家长综合考虑各中介的收费标准和服务内容，选择最适合自己的服务机构。