捷克留学可能存在以下不足之处：
教育资源分布不均：
捷克的教育资源相对集中，优质的学科和专业的优质资源大多集中在排名靠前的几所大学中。
语言障碍：
虽然多数捷克高校提供英文授课，但留学生可能还是需要适应一种新的语言环境，这可能会带来一定的挑战。
生活成本：
生活成本可能相对较高，尤其是在大城市中，住宿、饮食和其他日常开销可能会让留学生感到经济压力。
文化差异：
留学生可能会遇到文化差异，需要时间去适应新的生活方式和思维方式。
签证和居留权问题：
留学生可能需要面对签证申请和居留权获取的复杂流程。
学历认可度：
捷克免费的大学仅限于捷克语授课，而且学费方面几乎全免，但选择英语授课的话，学费会相对较高，并且捷克学历不被中国教育部认可。
学习难度：
如果选择捷克语授课，学生需要接受一年的捷克语课程并通过考试才可以上大学，这对一些学生来说可能是一个挑战。
综上所述，虽然捷克留学有其独特的优势，如安全指数较高、历史和文化资源丰富等，但留学生在选择捷克留学时，也需要仔细考虑上述不足之处，并做好充分的准备和规划。