最难考的理科学院排名如下：
1. 清华大学
2. 北京大学
3. 复旦大学
4. 上海交通大学
5. 中国人民大学
6. 中国科学技术大学
7. 南京大学
8. 浙江大学
9. 北京航空航天大学
10. 同济大学
建议：
清华大学和 北京大学通常被认为是理科大学中难度最大的，这两所大学的理科专业不仅录取分数线高，竞争也非常激烈。
复旦大学、 上海交通大学和 浙江大学也是理科大学中的佼佼者，理科实力非常强，尤其是它们的医学院和理工科相关专业。
中国科学技术大学以其科研实力著称，尤其在数学、物理等基础学科方面表现突出，录取难度也很大。
南京大学和 北京航空航天大学在理科的多个领域都有很高的声誉，尤其是北航在航空航天领域，录取难度也相当高。
这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各大学的理科实力和招生难度。建议考生在选择目标院校时，可以综合考虑自己的兴趣、专业目标以及历年的录取情况。