在日本，计算GPA（Grade Point Average）通常采用加权平均分算法，即每个课程的成绩乘以相应的学分，然后将这些加权成绩相加，最后除以总学分。具体的计算公式如下：
```
GPA = （课程1成绩 * 课程1学分 + 课程2成绩 * 课程2学分 + ... + 课程n成绩 * 课程n学分） / 总学分
```
例如，如果你在日本的大学学习了四门课程，分别获得了以下成绩和学分：
物理：90分，3个学分
数学：85分，6个学分
英语：90分，2个学分
体育：60分，1个学分
那么，按照加权平均分算法计算GPA为：
```
GPA = （90 * 3 + 85 * 6 + 90 * 2 + 60 * 1） / （3 + 6 + 2 + 1）
GPA = （270 + 510 + 180 + 60） / 12
GPA = 920 / 12
GPA ≈ 76.67
```
在日本，每个大学可能有自己特定的GPA计算标准，有的采用四分制，有的可能采用五分制。因此，如果你打算申请日本的大学，建议先了解你所在大学的GPA计算方式，或者直接向教授说明你所在院校的GPA算法。
需要注意的是，有些情况下，学生可能会选择进行成绩认证，比如通过World Education Services （WES） 算法，这可能会导致GPA的计算结果与学校官方算法有所不同。