日本留学入境体检的流程和注意事项如下：
体检流程
准备材料 ：身份证、近期大一寸免冠彩色照片四张（如有需要，带上国外体检和预防接种表格）。
体检费用：
大约500元人民币左右。
体检地点：
一般在当地的市、区等国家检验检疫局进行。
体检项目
一般检查：身高、体重、血压、脉搏、体温。
内外科、五官科检查。
胸部X线检查。
心电图。
腹部超声（肝、胆、脾、肾）。
实验室检查：HIV艾滋病检测、性病检测、乙型肝炎表面抗原、丙型肝炎抗体、肝功能（ALT或GPT）、血型、血生化、血常规（6项）、尿常规（4项）。
预防接种：
可能需要接种百白破、麻风腮、流脑和水痘等疫苗（具体请咨询各保健中心和医院）。
观察时间：
接种疫苗后，应在保健中心（医院）观察30分钟后才能离开。
体检结果：
通常需要四到五个工作日，体检合格者会获得黄色封面的检验检疫证，用于出入海关。
注意事项
体检前准备
体检前一天晚上饮食清淡，不要喝酒，保证充足睡眠。
体检前8-12小时尽量不要进食，保持空腹状态进行抽血化验及腹部B超检查。
妇科B超及男性前列腺B超检查前需膀胱充盈（胀尿）。
拍摄X光胸片时，要求腰部以上无金属、玉坠等物品，穿无扣子、无拉链、无图案的薄上衣。
体检时间：
建议在签证取得之后进行体检，避免不必要的费用。
请按照上述流程和注意事项准备，以确保顺利完成体检。