日本在土木工程领域拥有世界领先的研究和教育水平，特别是在抗震结构、地震工学、环境问题和城市开发方面。以下是一些建议的院校和土木工程专业的研究方向，供您参考：
国立大学
1. 东京大学
2. 京都大学
3. 东京工业大学
4. 横滨国立大学
5. 大阪大学
6. 筑波大学
7. 千叶大学
8. 东北大学
9. 名古屋大学
私立大学
1. 早稻田大学
2. 日本大学
3. 爱知工业大学
土木工程专业研究方向
1. 构造结构（结构力学、钢工学、桥梁工学等）
2. 地质地基（土质力学、地盘力学等）
3. 河川海岸（水理学、河川工学、海岸工学等）
4. 交通计画/都市计划
大学院专业课程方向
基盘技术和设计
地球水循环系统
管理
设计和景观
城市和交通
国际计划
空间信息
城市防灾
申请建议
关注热门研究方向，如BIM、物联网/自动控制、虚拟现实/增强现实技术的施工管理、高端统计建模的可靠度/风险管理、整合一体化、智能交通系统ITS等。
选择学校和研究方向时，建议您根据自己的专业背景和研究兴趣，参考目标院校的课程设置和研究方向，以及自己的课程表和成绩单，选择最适合自己的研究方向和学校。