日本留学生在选择大学时，可以考虑以下几所知名大学：
东京大学：
作为日本最顶尖的学府之一，东京大学在全球享有极高的声誉。其在理工科和人文社会科学方面都有深厚的研究底蕴，许多诺贝尔奖得主都曾在这里学习或工作。
京都大学：
京都大学是世界排名第30以内的顶尖综合研究型大学，在多个学科领域都有出色的研究成果。该校以“自由学风”闻名，理科和工科项目极具竞争力。
东北大学：
东北大学在医学、工学、理学等领域闻名，是日本知名的国立大学。鲁迅曾经在仙台一所专科学校学医，而这所专科学校后来就并入东北大学，成为现在的东北大学医学部。
大阪大学：
大阪大学是日本西部的学术重镇，在自然科学、工程技术和生物医学等领域具有很高的研究水平。其研究氛围既严谨又开放，鼓励学生自由探索和创新。
东京工业大学：
东京工业大学专攻工程技术与自然科学，是世界一流的理工科大学。其在光电子学、微波、半导体等研究领域国际评价很高。
慶应義塾大学：
慶应義塾大学是日本历史最悠久的私立综合性高等教育机构，主校区位于东京都中心位置。其在法学、文学、综合政策、经济学等学科具有很高的声誉。
早稻田大学：
早稻田大学是日本最知名的私立大学之一，也是留学生最多的大学之一。文科、商科、社会科学等学科在亚洲都有极高声誉。
庆应义塾大学：
庆应义塾大学是日本历史最悠久的私立综合性高等教育机构，主校区位于东京都中心位置。其在法学、文学、综合政策、经济学等学科具有很高的声誉。
上智大学：
上智大学本部位于日本东京，是一所世界级顶尖私立大学。其优势学科有国际教养、法学、外语、综合国际学等。
立命馆大学：
立命馆大学位于日本京都，在1988年设立了国际关系学院，国际关系研究科是世界著名大学加盟组织APSIA的日本唯一正式成员。优势学科有国际关系、经济学、经营学等。
建议留学生根据个人的兴趣、专业方向和语言水平来选择合适的大学。例如，如果对理工科特别感兴趣，东京工业大学和大阪大学是理想的选择；如果希望体验自由学风和深厚的学术氛围，京都大学是一个不错的选择；如果注重国际化和实用性，早稻田大学和慶应義塾大学值得考虑。