哈尔滨工程大学在本科专业方面有一些国家级和省级的特色专业，以下是一些重点专业和一流本科专业：
国家级特色专业
自动化
测控技术与仪器
核工程与核技术
轮机工程
探测制导与控制技术
能源与动力工程
水声工程
电子信息工程（水声）
省部级特色专业
工商管理
省重点、培育专业
核工程与核技术
土木工程
飞行器设计与工程
计算机科学与技术
数学与应用数学
机械设计制造及其自动化
工业设计
船舶与海洋工程
法学
英语
自动化
测控技术与仪器
电气工程及其自动化
能源与动力工程
轮机工程
港口航道与海岸工程
软件工程
一流本科专业（部分）
船舶与海洋工程
能源与动力工程
轮机工程
自动化
水声工程
计算机科学与技术
机械设计制造及其自动化
电子信息工程
工商管理
核工程与核技术
光电信息科学与工程
工程力学
测控技术与仪器
飞行器动力工程
电气工程及其自动化
请注意，以上信息以最新公布为准，具体排名可能会根据不同的评价体系和时间有所变化。