改革开放以来，我国共进行了 六次大规模的学科目录和专业设置调整工作。具体修订历程如下：
第一次修订目录于1987年颁布实施，专业种数由1300多种调减到671种，解决了“十年动乱”所造成的专业设置混乱的局面，专业名称和专业内涵得到整理和规范。
第二次修订目录于1993年正式颁布实施，专业种数为504种，重点解决专业归并和总体优化的问题，形成了体系完整、统一规范、比较科学合理的本科专业目录。
第三次修订目录于1998年颁布实施，修订工作按照“科学、规范、拓宽”的原则进行，使本科专业目录的学科门类达到11个，专业类71个，专业种数由504种调减到249种，改变了过去过分强调“专业对口”的教育观念和模式。
第四次修订目录于2012年颁布实施，新目录的学科门类由原来的11个增至12个，新增艺术学门类；专业类由原来的73个增至92个；专业由原来的635种调减至506种，其中基本专业352种，特设专业154种。
第五次修订目录于2020年颁布实施，在《普通高等学校本科专业目录（2012年）》基础上，增补了近年来批准增设的目录外新专业。
第六次修订目录于2021年完成，同意设置的国家控制布点专业和尚未列入专业目录的新专业名单，并对普通高等学校本科专业目录进行更新。