商丘学院截至2024年共有 53个本科专业，具体专业设置如下：
工学：
计算机科学与技术、软件技术、物联网工程、网络工程、信息与计算科学、电气工程及其自动化、机械设计制造及其自动化、汽车服务工程、车辆工程、通信工程、电子信息工程、机械电子工程、自动化、土木工程、工程造价、建筑工程技术、测绘工程技术、建设工程管理、市政工程技术、环境设计、视觉传达设计、动画、产品设计、服装与服饰设计、播音与主持艺术、广播电视编导、数学与应用数学、材料科学与工程、食品科学与工程、园艺、园林、城乡规划、建筑学、风景园林、食品检测技术、数控技术、汽车营销与服务、健身指导与管理、音乐学、公共艺术教学部。
农学：
食品科学与工程、园艺、园林、城乡规划。
管理学：
市场营销、人力资源管理、信息管理与信息系统（含数据分析与挖掘方向）、物流管理、电子商务、旅游管理、财务管理、审计学、会计、证券与期货。
艺术学：
传媒与艺术学院（环境设计、视觉传达设计、动画、产品设计、服装与服饰设计、播音与主持艺术、广播电视编导）、艺术与传媒学院、外国语学院（英语、日语、商务英语）、人文学院（汉语言文学、新闻学、广告学、学前教育（师范）、汉语国际教育）、马克思主义学院。
经济学：
经济学、国际经济与贸易。
教育学：
学前教育（师范）。
理学：
数学与应用数学、信息与计算科学。
法学：
马克思主义学院。
文学：
汉语言文学、新闻学、广告学。
其他：
对外汉语、城市规划。
商丘学院的专业设置涵盖了工、农、管、艺、文、教、理、经等多个学科领域，形成了多学科协调发展的专业格局。其中，河南省一流专业建设点有园林、土木工程、电气工程及其自动化等专业。