本科专业目录的设置原则主要包括以下几点：
适应国家和区域经济社会发展需要：
专业设置应主动适应国家和区域经济社会发展的需求，满足民众接受高质量高等教育的需求，同时要适应知识创新、科技进步以及学科发展的需要。
遵循高等教育规律和人才成长规律：
专业设置应符合学校办学定位和办学条件，优化学科专业结构，促进学校办出特色，提高人才培养质量。
提高教育质量和办学效益：
专业设置应有利于提高教育质量和办学效益，形成合理的学科和专业结构及布局，避免不必要的重复设置。
与学校属性定位相匹配：
高校在设置专业时，必须与其学校属性定位相匹配，并有足够的相关学科作为支撑。普通高等学校原则上按其分类属性设置专业，以形成自身优势和特色。
分类设置专业：
普通高等学校一般按照其分类属性设置专业，以形成自身优势和特色。设置学校分类属性以外的专业数一般不超过本校设置专业总数的30%。
专业范围明确：
专业目录中的专业名称应尽可能明确，对于专业范围较宽的专业，应在招聘条件中注明具体的专业范围。对于专业名称难以满足岗位细化专业要求的情况，可以标明专业方向。
与研究生层次专业相衔接：
依据本科专业目录设置本科层次专业后，要同时查阅《研究生学位授予和人才培养学科目录（试行）（2020年4月整理版）》，将研究生层次相关相近专业列入招聘范围。
灵活处理目录外专业：
对于目录外的专业，可以根据各高校实际设置专业情况一并设置，并在资格审查时对不了解的目录外专业，由资格审查小组报招聘组织机构相关负责人员商有关方面。
这些原则旨在确保本科专业目录的设置既符合教育规律，又能满足社会和经济发展的需求，同时保持高校的专业特色和优势。