南京的公办本科专业包括以下几所学校的部分专业：
南京大学
东南大学
南京航空航天大学
南京理工大学
南京工业大学
南京邮电大学
河海大学
南京林业大学
南京信息工程大学
南京农业大学
此外，南京工业职业技术大学在升格为职业本科学校后，也首次获批了6个本科专业，包括：
1. 机械电子工程
2. 自动化技术与应用
3. 电子信息工程
4. 软件工程
5. 工程管理
6. 国际经济与贸易
这些专业均为学校的优势专业，并在江苏本二批次参与招生。
建议在选择本科专业时，可以综合考虑学校的整体实力、专业设置以及个人兴趣和发展方向。