水上运输专科专业的代码为 5003。具体专业名称及代码如下：
航海技术：
专业代码500301
港口与航道工程技术：
专业代码500302
轮机工程技术：
专业代码500303
国际邮轮乘务管理：
专业代码500304
水路运输安全管理：
专业代码500305
港口机械与智能控制：
专业代码500306
港口与航运管理：
专业代码500307
船舶电子电气技术：
专业代码未提供
船舶检验：
专业代码未提供
集装箱运输管理：
专业代码未提供
建议选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，以及各个专业的就业前景和市场需求。