截至2024年，新疆的本科院校开设的专业十分丰富，涵盖了工、理、文、经、管、法、教育、艺术等多个学科门类。以下是部分本科院校及其王牌专业：
新疆大学
化学工程与工艺
中国少数民族语言文学
资源勘查工程
数学与应用数学
电气工程及其自动化
石河子大学
农学
农林经济管理
农业机械化及其自动化
临床医学
动物医学
新疆农业大学
园艺
水利水电工程
农业资源与环境
种子科学与工程
动物科学
农学
草业科学
新疆医科大学
临床医学
医学技术
药学
麻醉学
口腔医学
中药学
儿科学
法医学
医学检验技术
中医学
护理学
基础医学
生物医学工程
医学影像学
针灸推拿学
中西医临床医学
维医学
喀什大学
思想政治教育
学前教育
小学教育
计算机科学与技术
数据科学与大数据技术
医学检验技术
伊犁师范大学
思想政治教育
学前教育
小学教育
音乐学
地理科学
化学
教育技术学
美术学
舞蹈学
心理学
运动训练
中国少数民族语言文学
汉语国际教育
新疆财经大学
经济学
金融学
国际经济与贸易
工商管理类（工商管理、市场营销）
物流管理
新疆艺术学院
非物质文化遗产保护专业
此外，新疆的一些本科院校还根据时代发展和地方需求，新开设了一些本科专业，如人工智能、生物工程、大健康等新兴领域。
建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各专业的就业前景和发展潜力，选择最适合自己的发展方向。