滑铁卢大学的本科专业设置如下：
健康研究
运动机能学
娱乐与商务
休闲研究
娱乐治疗
会计与金融管理
人类学
著作研究
计算与金融管理
文化管理
数字传媒
戏剧
经济学
英语文学
美术
法语
地理与环境管理
历史
人类资源管理
认知科学
应用语言研究
环境经济学
财会管理
艺术事务
数码艺术通信
经济
英语（文学，文学和修辞，修辞和语文字）
法语及法语教育
地理
德语
31. 历史
32. 人力资源管理
33. 语文研习所
34. 独立研究
35. 商科
36. 精算学
37. 国际贸易
38. 应用数学
39. 科学与商业
40. 管理研究
41. 统计学
42. 环境科学
43. 环境与经济
44. 生物科技
45. 生物化学
46. 环境与资源研究
47. 化学工程
48. 建筑学
49. 环境工程
50. 化学
51. 生物信息学
52. 机械工程
53. 土建工程
54. 计算机科学
55. 软件工程
56. 组合与优化数学
57. 地球科学
58. 电子工程
59. 计算科学
60. 计算机工程
61. 纳米技术
62. 系统设计工程
63. 环境与商务
64. 地质工程
65. 管理工程
66. 政治科学
67. 心理学
68. 音乐
69. 法语研究
70. 演讲沟通
71. 社会学
72. 社会工作
73. 妇女研究
74. 药剂学
75. 眼科视光学
76. 老年学
77. 戏剧东亚研究
78. 政治科学
79. 古典研究
80. 社会发展研究
滑铁卢大学的专业设置涵盖了广泛的学科领域，包括商科、工程、计算机科学、数学、环境科学、人文社科等。其中，计算机科学、数学和工程学科的教学和研究水平位居世界前列，滑铁卢大学也是加拿大第一个提供计算机学位给学生的大学。