孤独症儿童教育专业已经作为本科专业被列入《普通高等学校本科专业目录》。该专业代码为040116TK，学制为四年，毕业后可授予教育学学士学位。
专业主要课程包括孤独症儿童心理与教育、特殊儿童教育诊断与评估、特殊儿童行为管理、个别化教育的理论与实践、融合教育理念与实践、孤独症儿童教育概论、孤独症儿童评估与教学、孤独症儿童的课程与教学、孤独症儿童言语与沟通训练、孤独症儿童社会性发展与教育等。
培养目标是面向孤独症专门学校、特殊教育学校、普通学校、特殊儿童康复机构、残联等，培养德、智、体、美全面发展，适应当代孤独症教育事业发展需要，扎实掌握以孤独症为主的特殊儿童发展和教育理论，具备对孤独症及其他发展性障碍儿童开展课程教学及其他相关教育服务的基本技能，富有博爱精神的应用型人才。
南京特殊教育师范学院是国内唯一开设孤独症儿童教育专业的本科院校。