本专科专业课的主要区别体现在以下几个方面：
培养目标
专科：主要培养具有特定专业技能的应用型人才，强调实践操作能力，能够在毕业后迅速进入相关领域的基层岗位工作。
本科：旨在培养具有扎实理论基础、创新能力和综合素养的专业人才，既注重专业知识的学习，又强调学生的思维能力、创新能力和综合素质的培养，能够在专业领域进行更深入的研究和创新，以及在更广泛的职业领域中发挥领导和管理作用。
课程设置
专科：课程紧密围绕专业技能展开，实践教学占比较大。例如，专科机械制造专业的课程可能包括机械制图、机械加工工艺、数控编程等，学生在校期间会有大量的实习、实训课程。
本科：课程体系更加全面和系统，包括公共基础课程、专业基础课程和专业核心课程等。理论教学和实践教学并重，注重培养学生的综合能力。例如，本科电气工程及其自动化专业的课程除了电路原理、电机学等专业课程外，还会设置大学物理、高等数学、英语等公共基础课程，以及电子电路实验、课程设计等实践环节。
教学内容和难度
专科：教学内容更注重实践技能的培养，课程难度相对较低，课时较短，通常为2-3年，重点更加突出。
本科：教学内容更注重学科的基础理论和研究方法的培养，课程难度相对较高，课时较长，通常为4年，注重学科的系统性和完整性。
学术研究和创新能力
专科：更注重应用技能的培养，专注于解决实际问题，进行产品开发和技术实现，通常不涉及深入的学术研究。
本科：更注重学术研究和创新能力的培养，本科生需要进行科研项目和实验室实践，掌握科学研究的方法和技能，具备独立进行科学研究和创新的能力。
毕业证书和修学时间
专科：通常为3年制，毕业后获得毕业证书，一般不授予学位。
本科：通常为4年制，毕业后获得学士学位证书和毕业证书。
学习环境和资源
本科：本科院校师资力量更为雄厚，相应的软硬件设施和资源更加齐全，在社会上的认可度也更高。
专科：虽然教学资源和师资力量相对较弱，但专科院校通常更专注于特定领域的技能培训。
综上所述，本专科专业课在培养目标、课程设置、教学内容和难度、学术研究和创新能力、毕业证书和修学时间以及学习环境和资源等方面都存在明显的区别。专科更注重实际应用和职业技能的培养，而本科则更侧重于学科理论知识的深入探究和综合能力的提升。