湖州学院拥有多个本科专业，涵盖工学、理学、医学、经济学、管理学、文学、艺术学等学科门类。以下是部分本科专业的简介：
工学
制药工程
计算机科学与技术
光电信息科学与工程
电子信息工程
电气工程及其自动化
材料化学
机械电子工程
理学
数学与应用数学
物理学
化学
生物科学
环境科学
医学
护理学
药学
经济学
经济学
国际经济与贸易
电子商务
经济与金融
管理学
物流管理
市场营销
应用心理学
行政管理
汉语言文学
文学
英语
日语
汉语言文学
艺术学
艺术学
音乐学
视觉传达设计
环境设计
产品设计
其他
旅游管理
历史学
生物技术
湖州学院坚持高水平应用型大学建设定位，立足湖州，面向浙江，辐射长三角，围绕智能制造、新材料新能源、数字经济、生命健康、高端服务业、文化创意等领域，加快推进学科专业布局调整，打造与区域产业结构紧密对接的、具有湖州学院特色的学科专业体系，实现人才培养与社会需求的“无缝对接”。
建议学生在选择专业时，结合个人兴趣和职业规划，充分考虑专业的学科特点、就业前景以及学校的办学特色和优势。