中外合作专科专业存在一些弊端，主要包括以下几点：
学费较高
学费通常比普通专业高出很多，给家庭经济条件一般的学生带来较大的经济负担。例如，一些中外合作专业的学费每年在5万元左右，而一些高端项目如上海纽约大学则高达12万元。
师资力量不稳定
合作双方的师资力量可能存在不稳定的情况，导致教学质量受到影响。
适应困难
学生需要适应不同的文化和教学环境，可能会面临一些适应困难和学习压力。
学习难度高
中外合作办学的课程有相当一部分采用外方教学模式，学习难度较高，课业压力较大，且对学生的语言能力要求较高。
不利于国内考研
由于中外合作办学的专业主要采用外方教材，国内考研时只能靠自学，且大三大四的课程密度高，自学时间较少，因此考研难度较大。
保研资格受限
除了部分中外合作办学二级学院项目外，其他中外合作办学专业通常没有保研资格，这对学生的未来发展有一定影响。
学习氛围问题
由于录取分数相对较低，可能会导致学习氛围不如普通专业，影响学生的学习效果。
专业学习内容受限
中外合作专业可能会有一部分时间用于学习与专业不直接相关的课程，这可能会影响学生在专业领域的深入学习。
综上所述，中外合作专科专业虽然提供了国际化的教育机会和优势，但高昂的学费、学习难度、适应困难以及不利于国内考研等问题也不容忽视。学生在选择中外合作办学专业时，应充分考虑自身的经济条件、学习能力和职业规划，做出明智的选择。