哈尔滨工业大学的本科专业设置如下：
航天学院
工程力学
复合材料与智能工程类（复合材料与工程、智能材料与结构）
飞行器设计与工程类（飞行器设计与工程、飞行器环境与生命保障工程、空间科学与技术）
光电工程类（电子科学与技术、光电信息科学与工程）
微电子科学与工程
自动化类（自动化、探测制导与控制技术、智能装备与系统）
电子与信息工程学院
信息与通信工程类（通信工程、电磁场与无线技术、遥感科学与技术、信息对抗技术、电子信息工程、智能测控工程）
机电工程学院
机器人与智能制造类（机械设计制造及其自动化、机械电子工程、飞行器制造工程、工业工程、机器人工程、智能制造工程）
材料科学与工程学院
先进材料与智能成形类（材料成型及控制工程、材料科学与工程、焊接技术与工程、电子封装技术、材料物理、增材制造工程、光电信息材料与器件）
能源科学与工程学院
智慧能源与空天动力类（能源与动力工程、飞行器动力工程、核工程与核技术、新能源科学与工程、储能科学与工程）
核工程与核技术
电气工程及自动化学院
电气工程及其自动化类（电气工程及其自动化、建筑电气与智能化）
仪器科学与工程学院
精密仪器及智能化类（精密仪器、智能感知工程、测控技术与仪器）
数学学院
数学类（数学与应用数学、信息与计算科学）
统计学
物理学院
应用物理学
光电信息科学与工程
经济与管理学院
经济管理试验班（信息管理与信息系统、大数据管理与应用、计算金融、电子商务、工商管理、市场营销、会计学、财务管理、国际经济与贸易、金融学、数字经济）
人文社科与法学学院
社会学
法学
经济学
马克思主义学院
思想政治教育
土木工程学院
土木类（土木工程、城市地下空间工程、智能建造、工程管理）
环境学院
环境生态工程（中外合作办学）
环境科学与工程类（环境工程、环境科学、环境生态工程）
给排水科学与工程类（城市水系统工程、给排水科学与工程）
建筑学院
建筑学
城乡规划
风景园林
智慧建筑与建造
建筑环境与能源应用工程
建筑学城乡规划风景园林数字媒体艺术环境设计
交通科学与工程学院
道路桥梁交通工程类（道路桥梁与渡河工程、交通工程、交通设备与控制工程）
计算学部
计算机科学与技术学院
国家示范性软件学院
网络空间安全学院
计算机类（计算机科学与技术、信息安全、网络空间安全、物联网工程、人工智能、数据科学与大数据技术、软件工程）
化工与化学学院
功能新材料与化工类（化学工程与工艺、高分子材料与工程、应用化学、新能源材料与器件）
化学类（化学、材料化学）
外国语学院
英语
俄语
日语
国际组织与全球治理
生命科学与技术学院
生物科学类（生物技术、生物工程、整合科学）
医学与健康学院
生物信息学
智能医学工程
生物医学科学
未来技术学院
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创新创业学院
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体育部
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空间环境与物质科学研究院（国家大科学工程）
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数学研究院
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生物信息技术研究院
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生命科学中心
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航空研究院
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人工智能研究院
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31. 现代农业研究院
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32. 中俄联合校园
数学与应用数学（中外合作办学）
应用物理学（中外合作办学）
化学