人类学专业
哲学专业
新闻学专业
交通运输工程专业
心理学专业
历史学专业
外国语言文学专业
政治专业
马克思主义理论专业
现代语音专业
计量经济学专业
力学专业（工程力学或力学与理论力学）
轻化工程专业
核工程与核技术（定向中核）
车辆工程（定向兵器工业）
工科试验班（为先书院，包含专业：测控技术与仪器、生物医学工程、材料科学与工程）
工科试验班（环境与化工类，包含专业：环境工程）
清华大学马克思主义学院
工艺美术系（纤维艺术、玻璃艺术、金属艺术与漆画艺术）
生命科学院
道德与宗教研究院
宗教学
武术与民族传统体育专业
这些专业可能由于就业前景、学科特点或报考人数较少而被视为冷门。不过，冷门专业也有其独特之处和优势，例如，某些专业可能更侧重于理论研究和学术深度，对于有志于深入学术领域或特定领域研究的学生来说，这些专业可能是一个不错的选择。在选择专业时，建议学生综合考虑自己的兴趣、职业规划以及学科发展前景。