东南大学是一所综合性、研究型大学，拥有丰富的院系和专业设置。截至2024年，东南大学下设35个院系，87个本科专业。以下是部分院系及其专业的详细列表：
建筑学院
建筑学
城乡规划
风景园林
机械工程学院
机械制造
机械电子
机械设计
工业工程
工业设计
车辆工程
能源与环境学院
热能与动力工程
建筑环境与设备工程
环境工程
核工程与核技术
信息科学与工程学院
通信与信息系统
信号与信息处理
电路与系统
电磁场与微波技术
土木工程学院
土木工程
工程管理
工程力学
智能建造
电子科学与工程学院
电子科学与技术
光学工程
数学学院
数学与应用数学
信息与计算科学
统计学
自动化学院
自动化
机器人工程
计算机科学与工程学院
计算机科学与技术
软件学院
软件工程
人工智能学院
人工智能
物理学院
物理学
应用物理学
生物科学与医学工程学院
生物医学工程
生物信息学
智能医学工程
生物医学工程（本硕连读）
材料科学与工程学院
金属材料
土木工程材料
电子电子信息材料
材料加工
人文学院
政治学与行政学
汉语言文学
旅游管理
社会学
哲学
经济管理学院
管理学类（信息管理与信息系统、工商管理、会计学、电子商务、物流管理）
经济学类（国际经济与贸易、金融学、经济学、金融工程）
电气工程学院
电气工程及其自动化
外国语学院
英语
日语
化学化工学院
化学工程与工艺
制药工程
化学
交通学院
交通工程
交通运输
道路桥梁与渡河工程
城市地下空间工程
测绘工程
港口航道与海岸工程
仪器科学与工程学院
测控技术与仪器
智能感知工程
艺术学院
产品设计
美术学
动画
法学院
法学
工程法
医学院
临床医学
医学检验
公共卫生学院
预防医学
劳动与社会保障（医疗保险方向）
网络空间安全学院
网络空间安全
吴健雄学院
工科试验班（吴健雄班，含东南大学四年制理工科类全部专业）
生命科学与技术学院
生物科学
生物工程
体育系
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马克思主义学院
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31. 海外教育学院
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32. 继续教育学院
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33. 微电子学院
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34. 雷恩研究生学院
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35. 东南大学-蒙纳士大学苏州联合研究生院
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这些专业涵盖了工、理、文、经、管、法、医等多个学科领域，体现了东南大学的综合性和研究型特色。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，以及各个专业的学科优势和就业前景。