截至2024年，西南医科大学共开设 33个本科专业，涵盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学、文学等多个学科门类。具体专业设置如下：
医学类
临床医学
麻醉学
医学影像学
精神医学
儿科学
口腔医学
预防医学
基础医学
中医学
中西医结合临床医学
药学
医学检验技术
医学影像技术
康复治疗学
眼视光学
卫生检验与检疫
理学类
护理学
药学
应用心理学
食品卫生与营养学
工学类
生物医学工程
信息管理与信息系统
智能医学工程
管理学类
公共事业管理
健康服务与管理
市场营销
法学类
法学
教育学类
社会体育指导与管理
休闲体育
文学类
英语
这些专业中，包括国家级和省级一流本科专业建设点各8个、国家级特色专业3个、省级特色专业3个、省级应用型示范专业5个。此外，学校还推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士研究生资格，并承担了国家医学教育改革项目5个。
建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及专业的就业前景和学术实力，选择最适合自己的发展方向。