本科专业目录中没有某些专业，可能是由以下原因造成的：
高校的招生方式：
高校可能会采用大类招生或各类试验班等方式进行招生。这种情况下，招生计划目录和本科专业目录不能完全对应。例如，学生入校后可能会根据个人兴趣和成绩进行专业分流，而不是直接进入具体的专业学习。
同一专业的不同专业方向：
高校有时会将同一个专业分为不同的专业方向。例如，同一个专业可能会包含不同的课程设置和培养目标，从而在本科专业目录中体现为不同的专业名称。例如，经济学门类下的“国民经济管理”和“能源经济”等特设专业，以及法学门类下的“监狱学”等专业。
专业设置的调整：
高校可能会根据社会需求和自身特色设置新的专业，这些专业可能在正式发布的本科专业目录中尚未列入。
省份或学校限制：
如果填志愿的时候某些专业在专业目录上没有，是因为该专业没有在你所在的省份招生，或者你所报考的学校没有这个专业。
因此，在填报志愿时，建议考生仔细查看目标高校的招生计划，了解专业的具体设置和招生方向，以确保选择的专业在本科专业目录中有对应项。