是的，本科阶段有考古学专业，并且女生可以选择这个专业。
考古学是历史学大类下的一个一级学科，本科阶段分为考古学专业和博物馆学专业，系文理交叉学科。考古学专业包括多个研究方向，如史前考古学、动物考古学、植物考古学等。此外，还有与考古学密切相关的专业，如文物与博物馆学、文物保护技术等。
从就业方向来看，考古学专业毕业生可以选择进入考古所、文物局、博物馆、文保中心、高校、勘探公司等多个领域工作。虽然考古专业的工作环境有时较为艰苦，需要面对野外工作和较大的体力劳动，但仍有不少女性在这个领域中取得了成就。
因此，如果女生对古文物充满兴趣，并且愿意面对可能的工作挑战，本科选择考古学专业是一个值得考虑的选择。