关于本科专业合并后的毕业证问题，可以得出以下结论：
毕业证类型：
无论学校如何合并，只要学生的入学学历是专科，那么毕业时颁发的仍然是专科毕业证。
毕业证名称：
如果学校在合并后更名，那么新颁发的毕业证将使用新校名，但不会影响学生的学历。
合并影响：
合并后，对于三本院校的学生来说，有利于促进普通高等学校公平发展，消除因批次划分可能带来的政策歧视，促进普通高等学校平等竞争和平等就业。
毕业证内容：
本科大学的毕业证上写的是“本科”，并没有二本或三本之分。因此，即使学校进行合并，只要专业没有升本，毕业证上仍然是“专科”。
综上所述，本科专业合并后，学生的毕业证类型和名称主要取决于学生入学时的学历和学校合并后的名称，而不会因合并而改变其学历层次。建议学生在选择学校时，可以综合考虑学校的整体实力和发展前景，而不仅仅是关注其招生批次。