生物制药本科专业培养的目标是 培养具备扎实的生物技术和药学基础理论、基本知识，熟练掌握现代生物技术和制药技术的常用实验流程，初步了解生物技术制药企业生产和销售环节的流程，能够胜任现代生物技术实验室和生物技术制药企业岗位基本要求的德、智、体、美全面发展的技术应用型高级实用人才。
在知识能力方面，学生应掌握化学制药、生物制药、药物制剂技术与工程的基本理论和基本知识；掌握药物生产装置工艺与设备设计方法；具有对药品的新资源、新产品、新工艺进行研究、开发和设计的初步能力；熟悉国家对于化工与制药生产、设计、研究与开发、环境保护等方面的方针、政策和法规；了解制药工程与制剂方面的理论前沿，了解新工艺、新技术和新设备的发展动态；熟悉掌握一门外语，具备听、说、读、写能力，掌握文献检索、资料查询的基本方法，具有一定的科学研究和实际工作能力。
专业课程设置本科阶段主要开设课程大体包括生物化学、微生物学、微生物与免疫学、分子生物学、药理学、药物化学、药物分析、药剂学、基因工程原理等。各校根据培养方式和要求不同，课程设置也有所差异。
综上所述，生物制药本科专业培养注重理论与实践相结合，旨在培养具备专业知识和技能，能够在生物制药领域从事研发、生产、管理等方面工作的应用型人才。